プロテオミクスデータ

この章では、プロテオミクスデータの標準化に焦点を当てています。他の科学者による検証を有効にするには、プロテオミクス実験結果の共有と詳細な説明科学研究の基本原則である。しかし、機器ベンダーから提供されたデータフォーマットの広大な異質性が公表された結果の検証を困難に、この分野での進歩を妨げている。プロテオミクス規格上のヒトプロテオーム機構イニシアティブ(HUPO-PSI)は、プロテオミクスデータ表現のためだけでなく、プロテオミクス実験(MIAPE)に報告する際に含まれるべき最小限の情報を述べるガイドラインの説明で基準の定義に取り組んできました。このような最低限の情報は、全体のプロセスの重要な評価と仕事の潜在的な繰り返しが可能、実験プロトコルおよびデータ処理方法の両方を含む完全な実験を、記述しなければならない。この章では、MIAPEガイドラインとXMLデータ形式に焦点を当て、HUPO-PSIによって行われる標準化作業について説明します。また、メインプロテオミクスデータリポジトリは、実験パイプラインへのデータ規格の統合に必要なアプリケーションプログラミングinterphases(API)を同様に記載されている。最後に、検査、検証、報告および統計プロテオミクスデータ標準およびデータ分析ツールに生データを変換するためのバイオインフォマティクスツールを分析する。

今日の社会は、原因の患者および心血管や神経変性疾患の優位性だけでなく、カスタマイズされた治療法を必要とする様々な形態の癌に代表される、変更された疾病プロファイル数の増加に改善されたヘルスケア·ソリューションのために手を差し伸べる必要があります。また、将来における薬剤開発の標的となる可能性があり、診断および治療のバイオマーカーのための大規模な必要性がある。ヒトプロテオーム機構が主催する国際的な研究の焦点が合っている臨床研究で、これらの潜在的なタンパク質マーカーを同定し、定量化するために極端な特異性で、感度ならびに新規方法論を強化質量分析申し出、率いる現代の分析プラットフォーム。しかし、臨床サンプルおよびタンパク質の広い濃度範囲の複雑さは、分析タスクを表し、まだ達成される必要がある。この章では、ヘルスケア·システムは、今日直面している課題を提示し、バイオバンクの標準化、個別化医療と関連する例は、質量分析技術を使用して、可能な解決策の概要を説明します。